Eaton County är ett administrativt område i delstaten Michigan, USA. År 2010 hade countyt 107 759 invånare. Den administrativa huvudorten (county seat) är Charlotte. Countyt har fått sitt namn efter politikern John Eaton.
Enligt United States Census Bureau har countyt en total area på 1 500 km². 1 497 km² av den arean är land och 7 km² är vatten.